Kabuto a été présenté pour la première fois dans l'arc des examens Chunin, où il a participé à l'examen en tant que shinobi du village d'Oto. Après que ses véritables intentions aient été dévoilées, il est devenu l'un des personnages les plus populaires de la série. Il a même réussi à surpasser son maître, Orochimaru, de certaines manières et est devenu un méchant largement acclamé dans la série.
Il a joué un rôle essentiel pendant la quatrième grande guerre ninja, en ressuscitant à lui seul de nombreux shinobis légendaires, un exploit que même Tobirama admirait.